بدأ فرع جامعة قم الدولي نشاطاتها بعد الحصول علي تصريح من وزارة التعليم العالي الايرانية وذلک في إطار تطور الدولة العلمي وتنفيذ ما تضمه وثيقة التصور المستقبلي للدولة حتي عام 2025 الميلادي. أخذ فرع جامعة قم الدولي استقبال الطلبة في مرحلة الماجستير والدکتوراة في فروع مختلفة عام 2012 الميلادي. الجدير بالذکر بأن شهادات هذا الفرع مصرحة بها من قبل وزارة التعليم العالي الايرانية. يقدم فرع جامعة قم الدولي أربعة برامج لمرحلة الدکتوراة و13 برامجا لمرحلة الماجستير وذلک کالتالي:
مرحلة الدکتوراة:
1 ـ علوم القرآن والحديث
2 ـ الفقه ومبادئ القانون الإسلامي
3 ـ الفلسفة المقارنة
4 ـ الکلام
مرحلة الماجستير:
1 ـ فيزياء الجوامد (فيزياء الحالة الصلبة)
2 ـ الرياضيات البحتة
3 ـ اللغة العربية وآدابها
4 ـ اللغة الفارسية وآدابها
5 ـ القانون الخاص
6 ـ القانون الجنائي وعلم الجريمة
7 ـ قانون الملکية الفکرية
8 ـ علوم القرآن والحديث
9 ـ الفقه ومبادئ القانون الإسلامي
10 ـ دراسات الشيعة
11 ـ المحاسبة
12 ـ هندسة تقنية المعلومات
13 ـ هندسة العمران (الهياکل الإنشائية)